Wissenschaftler des St. Jude Children’s Research Hospital haben einen kostengünstigen, einfach anzuwendenden Test entwickelt, um Krebserkrankungen bei Kindern zu kategorisieren und eine bessere Behandlung zu ermöglichen.
Wissenschaftler am St. Jude Children’s Research Hospital haben ein Panel entwickelt, das durch die Sequenzierung von 0,15 % des menschlichen Genoms eine Diagnose für über 90 % der pädiatrischen Krebspatienten stellen kann. Das Panel ist eine kostengünstige Methode, um Krebserkrankungen bei Kindern zu testen und zu klassifizieren und die Behandlung der Patienten zu steuern. Die Leistung und Validierung des Panels wurden diese Woche in Clinical Cancer Research veröffentlicht .
Das Auffinden der Mutationen bei Krebserkrankungen von Kindern mithilfe leistungsstarker Sequenzierungstechnologie kann zu besseren Ergebnissen führen. Ärzte nutzen dieses Wissen, um gezielte Behandlungen auf die spezifischen krebserregenden Mutationen jedes Patienten abzustimmen. Die aktuelle High-End-Genomsequenzierung erfordert jedoch eine physische und rechnerische Infrastruktur, die den meisten Einrichtungen fehlt. Um diesen Engpass zu beheben, entwickelte das Team von St. Jude SJPedPanel, das eine kleinere Untergruppe von Genen anvisiert und sich auf diejenigen konzentriert, von denen bekannt ist, dass sie an Krebserkrankungen bei Kindern beteiligt sind, anstatt das gesamte Genom zu untersuchen.
Die Gruppe entwickelte das neue Panel von Anfang an für Krebsproben bei Kindern, während andere genetische Panels für Krebs bei Erwachsenen entwickelt und dann für Kinder angepasst wurden. Die Wissenschaftler hatten auch praktische Einblicke in die Realitäten der Erkennung bestimmter Mutationen, sodass sie die aussagekräftigsten Gene auswählen konnten. Diese Unterschiede führten zu enormen Leistungsvorteilen im Vergleich zu bestehenden Krebsgen-Panels.
„Wir haben dieses Panel mit sechs anderen im Handel erhältlichen Panels verglichen“, sagte Ma. „SJPedPanel bietet die größte Abdeckung von pädiatrischen Krebstreibergenen und erreicht fast 90 %, während andere Panels nur eine Abdeckung von fast 60 % erreichen.“
Diese verbesserte Leistung war das Ergebnis engagierter Bemühungen. „Wir haben eine iterative Optimierung eines sorgfältigen Paneldesigns durchgeführt, das auf unserem Wissen über die Genetik von Krebs bei Kindern basiert“, sagte Co-Autor Dr. John Easton, Direktor des St. Jude Computational Biology Genomics Laboratory , der zuvor als Leiter des Validierungslabors für das Pediatric Cancer Genome Project fungierte. „Und wir haben diesen iterativen Prozess mit dem Panelhersteller fortgesetzt, um dessen Fähigkeiten sicherzustellen.“
